Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc163A2AGD7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc163A2AGD7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms