Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2dnl2A2AFH2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms