Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calcoco2A2A6M5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms