Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930469K13RikA0A286YDB2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930469K13RikA0A286YDB2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930469K13RikA0A286YDB2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930469K13RikA0A286YDB2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930469K13RikA0A286YDB2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930469K13RikA0A286YDB2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930469K13RikA0A286YDB2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930469K13RikA0A286YDB2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
4930469K13RikA0A286YDB2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930469K13RikA0A286YDB2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930469K13RikA0A286YDB2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930469K13RikA0A286YDB2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930469K13RikA0A286YDB2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930469K13RikA0A286YDB2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930469K13RikA0A286YDB2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930469K13RikA0A286YDB2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930469K13RikA0A286YDB2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930469K13RikA0A286YDB2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930469K13RikA0A286YDB2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930469K13RikA0A286YDB2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930469K13RikA0A286YDB2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930469K13RikA0A286YDB2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
4930469K13RikA0A286YDB2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930469K13RikA0A286YDB2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930469K13RikA0A286YDB2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930469K13RikA0A286YDB2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms