Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
A0A0U1RNP2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms