Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms