Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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