Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTR2

0610012G03Rik, RIKEN cDNA 0610012G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms