Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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