Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE3

Trbv15, T cell receptor beta, variable 15 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv15A0A0A6YYE3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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