Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Olfr360-202ENSMUST00000216706 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm14977-201ENSMUST00000121626 812 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm16471-201ENSMUST00000121940 618 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm15866-201ENSMUST00000149048 785 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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