Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm22758-201ENSMUST00000102275 96 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm4035-202ENSMUST00000190684 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Igkv1-135-201ENSMUST00000103303 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm27162-201ENSMUST00000185169 2478 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Xlr5d-ps-201ENSMUST00000117501 782 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm13232-201ENSMUST00000121816 632 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm22501-201ENSMUST00000158981 127 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm18462-201ENSMUST00000208112 417 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 AC137961.1-201ENSMUST00000227924 734 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 BC048502-201ENSMUST00000065978 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm23099-201ENSMUST00000083454 139 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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