Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 AC122465.3-201ENSMUST00000221644 355 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Olfr885-201ENSMUST00000081985 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ubash3bQ8BGG7 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm14172-201ENSMUST00000118255 644 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ubash3bQ8BGG7 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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