Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm23099-201ENSMUST00000083454 139 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm38221-201ENSMUST00000195146 365 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm44009-201ENSMUST00000203539 521 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Rpl26-ps5-201ENSMUST00000122220 439 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm8823-201ENSMUST00000193158 433 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Xlr5d-ps-201ENSMUST00000117501 782 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Apoo-ps-201ENSMUST00000061241 586 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms