Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
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Rpusd2Q149F1 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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Rpusd2Q149F1 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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Rpusd2Q149F1 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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Rpusd2Q149F1 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
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Rpusd2Q149F1 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Rpusd2Q149F1 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Rpusd2Q149F1 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gmeb1-207ENSMUST00000168553 6523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Rpusd2Q149F1 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Rpusd2Q149F1 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Rpusd2Q149F1 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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Rpusd2Q149F1 Epg5-201ENSMUST00000044622 9672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Rpusd2Q149F1 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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