Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm17575-201ENSMUST00000180437 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Ppp2r3c-201ENSMUST00000021410 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Hipk2-207ENSMUST00000162359 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Thrb-201ENSMUST00000022303 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Uba7-201ENSMUST00000035216 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm4767-202ENSMUST00000188096 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Abr-201ENSMUST00000065028 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm29028-201ENSMUST00000186297 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Pi4ka-201ENSMUST00000036161 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Zfp472-201ENSMUST00000039132 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Ttll4-201ENSMUST00000042125 10019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gfpt2-201ENSMUST00000020629 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Pdgfd-201ENSMUST00000058692 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm18913-201ENSMUST00000204311 1789 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Entpd5-202ENSMUST00000072061 4858 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Cep170-212ENSMUST00000194727 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Tnfrsf11b-201ENSMUST00000079772 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Naca-202ENSMUST00000092048 6745 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Map1a-202ENSMUST00000110639 10145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 4921521D15Rik-201ENSMUST00000197578 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm25690-201ENSMUST00000175439 77 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm45708-202ENSMUST00000212785 2752 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms