Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Rpl31-ps18-201ENSMUST00000180885 377 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprkP35822 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprkP35822 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprkP35822 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprkP35822 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprkP35822 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprkP35822 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprkP35822 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprkP35822 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm15038-201ENSMUST00000122144 296 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtprkP35822 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Arfgef3-202ENSMUST00000215836 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PtprkP35822 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm15263-201ENSMUST00000121556 642 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprkP35822 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprkP35822 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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