Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Map1b-201ENSMUST00000064762 11808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Olfr1079-203ENSMUST00000216480 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm45697-201ENSMUST00000212893 2876 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Olfr510-203ENSMUST00000216331 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprmP28828 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprmP28828 AC154241.1-201ENSMUST00000223952 356 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprmP28828 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
PtprmP28828 4930528J11Rik-201ENSMUST00000201689 3611 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm5924-201ENSMUST00000132554 871 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm13092-201ENSMUST00000136346 260 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms