Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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Ggta1P23336 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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Ggta1P23336 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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Ggta1P23336 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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Ggta1P23336 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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Ggta1P23336 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ggta1P23336 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ggta1P23336 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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Ggta1P23336 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ggta1P23336 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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Ggta1P23336 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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Ggta1P23336 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ggta1P23336 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ggta1P23336 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ggta1P23336 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ggta1P23336 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ggta1P23336 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ggta1P23336 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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