Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm36638-201ENSMUST00000193295 400 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms