Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OtofQ9ESF1 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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