Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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BcanQ61361 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
BcanQ61361 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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BcanQ61361 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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BcanQ61361 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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BcanQ61361 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BcanQ61361 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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