Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm7363-201ENSMUST00000119883 399 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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Znf48Q3US17 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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Znf48Q3US17 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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Znf48Q3US17 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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Znf48Q3US17 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm45194-202ENSMUST00000207962 1991 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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Znf48Q3US17 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Znf48Q3US17 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Znf48Q3US17 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Znf48Q3US17 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Znf48Q3US17 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Znf48Q3US17 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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Znf48Q3US17 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Znf48Q3US17 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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Znf48Q3US17 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm44245-201ENSMUST00000204304 232 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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