Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 AC125523.1-201ENSMUST00000228018 934 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Siah1bQ06985 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms