Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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Cldn18P56857 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms