Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxc11P31313 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxc11P31313 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxc11P31313 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxc11P31313 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxc11P31313 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxc11P31313 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxc11P31313 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxc11P31313 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxc11P31313 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxc11P31313 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxc11P31313 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxc11P31313 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxc11P31313 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxc11P31313 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hoxc11P31313 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hoxc11P31313 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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