Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Ccdc47Q9D024 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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Ccdc47Q9D024 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Ccdc47Q9D024 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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