Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Olfr677-201ENSMUST00000098161 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms