Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms