Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
BcanQ61361 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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BcanQ61361 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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BcanQ61361 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
BcanQ61361 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms