Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm23115-201ENSMUST00000158480 108 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp19Q3UJD6 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.6 ms