Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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