Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm23663-201ENSMUST00000158045 80 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Pglyrp4-203ENSMUST00000169698 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 D7Ertd443e-201ENSMUST00000094002 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm16316-201ENSMUST00000154065 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm12993-201ENSMUST00000119900 479 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm28548-201ENSMUST00000191599 409 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm42767-201ENSMUST00000198583 632 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gsdmc4-202ENSMUST00000188108 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Jakmip2-201ENSMUST00000082254 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxa2P31245 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms