Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Calml4-203ENSMUST00000213643 710 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm26165-201ENSMUST00000083791 138 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm4526-201ENSMUST00000186039 920 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm7449-201ENSMUST00000194393 663 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm10042-201ENSMUST00000079884 78 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprmP28828 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm6079-201ENSMUST00000121356 404 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprmP28828 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprmP28828 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprmP28828 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprmP28828 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprmP28828 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms