Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Olfr830-201ENSMUST00000078861 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.4
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Hoxd9P28357 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
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Hoxd9P28357 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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Hoxd9P28357 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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Hoxd9P28357 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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Hoxd9P28357 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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Hoxd9P28357 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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Hoxd9P28357 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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