Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
H2-Eb1P04230 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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H2-Eb1P04230 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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H2-Eb1P04230 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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H2-Eb1P04230 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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H2-Eb1P04230 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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H2-Eb1P04230 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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H2-Eb1P04230 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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H2-Eb1P04230 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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H2-Eb1P04230 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
H2-Eb1P04230 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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