Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm44993-201ENSMUST00000208435 842 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms