Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14172-201ENSMUST00000118255 644 ntBASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22789-201ENSMUST00000157884 130 ntBASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r39-206ENSMUST00000228651 2144 ntAPPRIS ALT2 BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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