Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm24871-201ENSMUST00000083099 116 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Rnu5g-201ENSMUST00000093721 116 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rab11fip3Q8CHD8 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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