Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Slc9c1-201ENSMUST00000159945 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
NischQ80TM9 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 AC183268.1-201ENSMUST00000215753 2837 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm37304-201ENSMUST00000193833 2886 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm44009-201ENSMUST00000203539 521 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Ktn1-226ENSMUST00000191511 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Plec-218ENSMUST00000169714 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Plec-201ENSMUST00000023226 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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