Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Olfr97-204ENSMUST00000214622 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps2-201ENSMUST00000121053 765 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm23014-201ENSMUST00000104144 130 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm13232-201ENSMUST00000121816 632 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 AC074315.1-201ENSMUST00000228801 214 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm45635-201ENSMUST00000211516 2134 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Olfr819-202ENSMUST00000216322 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm22758-201ENSMUST00000102275 96 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms