Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm18644-201ENSMUST00000211458 815 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Stfa1-201ENSMUST00000042097 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
VdrP48281 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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VdrP48281 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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VdrP48281 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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VdrP48281 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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VdrP48281 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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VdrP48281 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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VdrP48281 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
VdrP48281 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
VdrP48281 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
VdrP48281 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
VdrP48281 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
VdrP48281 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
VdrP48281 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
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