Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Prrt4B2RU40 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms