Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Apoo-ps-201ENSMUST00000061241 586 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm11958-201ENSMUST00000127224 253 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Rpl32-ps-201ENSMUST00000091052 506 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Zfp989-202ENSMUST00000146688 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms