Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxa13Q62424 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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Hoxa13Q62424 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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Hoxa13Q62424 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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Hoxa13Q62424 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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Hoxa13Q62424 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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Hoxa13Q62424 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152 ms