Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd10P28359 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Hoxd10P28359 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Hoxd10P28359 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Hoxd10P28359 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Hoxd10P28359 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Hoxd10P28359 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Hoxd10P28359 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms