Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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Hoxd9P28357 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd9P28357 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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