Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
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Ccl20O89093 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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Ccl20O89093 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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Ccl20O89093 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
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Ccl20O89093 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
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Ccl20O89093 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
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Ccl20O89093 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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Ccl20O89093 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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Ccl20O89093 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
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Ccl20O89093 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
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Ccl20O89093 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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Ccl20O89093 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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