Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm38330-201ENSMUST00000192743 959 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Opn1mwO35599 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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