Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm26355-201ENSMUST00000158220 105 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms